当司机在交通事故中死亡时，处理流程和赔偿事宜如下：
保险赔偿：首先由承保机动车强制保险的保险人在强制保险责任限额范围内予以赔偿。如果不足部分，由承保机动车商业保险的保险人按照保险合同的约定予以赔偿。如果仍然不足或者没有投保机动车商业保险，由责任人赔偿。
继承人赔偿：若驾驶员没有留下遗产或遗产不足以赔偿，则由其法定继承人承担相应的赔偿责任。
交通肇事罪：如果驾驶员负事故的全部或主要责任，并且事故导致人员死亡，则涉嫌交通肇事罪，需要承担刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，肇事者可能会被判处七年以上有期徒刑。
吊销驾驶证：对于构成交通肇事罪的司机，除了刑事责任外，交警部门会依法吊销其驾驶证，并且可能终生不得重新取得驾驶证。
丧葬费：按照受诉法院所在地上一年度职工月平均工资标准，以六个月总额计算。
死亡赔偿金：按照受诉法院所在地上一年度城镇居民人均可支配收入或者农村居民人均纯收入标准，按二十年计算。
其他费用：包括受害人亲属办理丧葬事宜支出的交通费、住宿费和误工损失等。
精神损害赔偿：死者近亲属遭受精神损害，赔偿权利人可以向人民法院请求赔偿精神损害抚慰金。
建议
及时报案：在发生交通事故后，应立即向公安机关报案，以便及时进行事故调查和责任认定。
保留证据：事故现场照片、监控录像、医疗记录等证据对于后续的赔偿和刑事责任追究至关重要。
咨询律师：在处理此类复杂的法律问题时，建议咨询专业律师，以便更好地维护自身权益。
以上信息基于最新的法律法规和司法解释，具体案件的处理可能会有所不同，建议在实际操作中结合具体情况进行详细分析和处理。
