签订三方协议后，档案的处理方式主要取决于三方协议中是否明确了档案的保管地点和方式，以及公司的档案保存权。以下是几种可能的处理方式：
如果公司具备档案保存权，那么可以直接将档案转到公司进行保存。这种情况下，工龄会在档案中逐年增加，并且档案会由公司进行管理。
如果公司没有档案保存权，那么可以与公司协商将档案转到公司所在地的人才市场进行保存。这种方式下，档案会由人才市场进行管理，并且可以继续计算工龄。
如果实在不想将档案转到公司或人才市场，也可以选择将档案打回原籍，由个人自行处理。这种方式下，档案会回到原籍所在地，可能会由当地的档案管理部门或人才中心进行保管。
某些情况下，可以选择将档案留在学校就业指导中心进行保管，尤其是还未找到工作的毕业生。这种方式下，档案会由学校进行管理，直到找到新的工作单位后再进行转移。
可以选择与毕业学校所在省高等学校毕业生就业指导中心签订协议，在协议期内，由该就业指导中心为毕业生提供档案材料保管服务。这种方式下，档案会由就业指导中心进行管理，适用于在有人事权的单位就业的情况。
建议
提前规划：在签订三方协议前，建议先了解自己和公司的档案保存权，以便提前规划好档案的转移方式。
仔细阅读三方协议：仔细阅读三方协议中关于档案处理的条款，确保按照协议约定进行档案转移。
及时沟通：如果在档案转移过程中遇到问题，及时与公司或相关部门沟通，确保档案能够顺利转移。
以上信息仅供参考，具体操作还需根据个人情况和当地政策进行。
