药店公司主要涉及的税种包括以下几种：
药店销售药品属于应税销售行为，需缴纳增值税。小规模纳税人税率为3%，一般纳税人税率为17%。
城建税是增值税、消费税和营业税的附加税，根据纳税人所在地的不同，税率分别为7%、5%和1%。
教育费附加是增值税、消费税和营业税的附加税，税率为3%。
地方教育费附加是增值税、消费税和营业税的附加税，税率为2%。
药店在签订合同时需要缴纳印花税，例如租赁房屋的印花税为0.1%，购销合同的印花税为万分之五。
药店如果是企业形式经营，需就其所得缴纳企业所得税。一般企业所得税的法定税率为25%，但对于国家需要重点扶持的高新技术企业，税率为15%；小型微利企业为20%；非居民企业为20%。
药店中的个人收入（如工资、奖金等）达到一定标准后需要缴纳个人所得税。
如果企业拥有房产产权，需缴纳房产税。房产税在城市、县城、建制镇、工矿区范围内，对拥有房屋产权的内资单位和个人按照房产税原值或租金收入征收。
按照实际占用面积乘以规定的税率（例如每平方米2元）年度缴纳。
根据具体经营情况，药店可能还需要缴纳其他税种，如水利建设基金、价调金、防洪护堤费等。
综上所述，药店公司需要缴纳的税种较多，具体税率和应纳税额应根据药店的实际情况和当地税务部门的规定来确定。建议药店公司在经营过程中，咨询当地税务部门或专业税务顾问，以确保合法合规经营。
