扣得工资主要计入以下科目：
应付职工薪酬是企业根据劳动合同、国家相关法规以及内部管理制度，应当支付给员工的各种薪酬，包括基本工资、奖金、津贴、补贴、社保费用等。当企业从员工工资中扣除某些款项时，这些扣款实质上减少了应付给员工的薪酬总额，因此，从工资中扣除的任何款项应纳入应付职工薪酬这一科目。
企业发放员工薪资时的扣款，如代扣代缴的个人所得税、社保、公积金等，应计入“其他应收款”科目里核算。具体会计分录为：借：应付职工薪酬—工资，贷：库存现金/银行存款（实发工资数），其他应付款—养老保险/医疗保险等（个人支付部分），其他应付款—住房公积金（个人支付部分），应交税费—应交个人所得税（代扣代缴个税），其他应收款（其他应扣款）。
工资扣款中涉及到的社保、公积金等代扣款项，通过“其他应付款”科目进行核算。在工资支付过程中，这些款项会计入其他应付款的贷方，当实际支付代扣的保险、公积金时，从借方转出。
因个人所得税而扣的工资，一般会通过“应交税费”科目来处理。具体会计分录为：借：应付职工薪酬，贷：应交税费—应交个人所得税。
建议
在实际操作中，企业应根据具体业务需求和会计准则的要求，选择恰当的科目进行核算，确保会计处理的准确性和合规性。
