员工卷款逃跑的立案标准依据具体情况而定，通常分为以下几种情形：
1. 如果涉嫌职务侵占罪，金额在5000元至10000元以上的，公安机关应予立案。
2. 如果涉嫌盗窃罪，金额达到1000元以上的，可以立案。
3. 如果携带公款逃跑20000元以上，可能构成携款潜逃罪，根据相关法律规定，可能以贪污罪定罪处罚。
请根据具体情况判断是否达到立案标准，并咨询专业法律人士以获得更准确的法律意见
