物流主要由 交通运输部门进行管制。具体来说，根据《道路货物运输及站场管理规定》第五条，交通运输部主管全国道路货物运输和货运站管理工作，而县级以上地方人民政府交通运输主管部门则负责组织领导本行政区域内的道路货物运输和货运站管理工作。此外，虽然物流公司的管理也涉及工商、税务等部门，但交通运输管理部门是主要的监督和管理机构。
因此，可以得出结论，物流行业主要受到交通运输部门的管制，同时涉及其他相关部门如工商、税务等。
