员工补贴通常应计入应付职工薪酬科目。具体的会计分录处理如下：
1. 当企业计提员工补贴时：
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借：管理费用/销售费用/制造费用/生产成本/劳务成本/工程施工等相关费用科目
贷：应付职工薪酬——补贴
2. 实际发放补贴时：
借：应付职工薪酬——补贴
贷：银行存款/库存现金
这样的处理能够清晰地反映企业的经济业务和财务状况，并且符合相关法规和会计准则的要求。
