医保（城镇职工基本医疗保险）和合作医疗（新型农村合作医疗）的主要区别包括：
医保面向城镇职工和灵活就业人员。
合作医疗主要针对农村户口的人群。
医保由个人和雇主共同缴纳，按月支付。
合作医疗通常由农民个人每年一次性缴纳。
医保的报销比例通常在70%-90%之间，覆盖范围广，包括门诊、住院、买药等费用。
合作医疗的报销比例一般在50%-70%之间，主要报销住院医疗费用。
医保的缴费与个人工资和当地平均工资挂钩。
合作医疗的费用相对较低，每年几百元。
医保在累计交满一定年限（如25年）后，可享受终身医保待遇。
合作医疗为一年一缴，保险期限仅为一年。
医保通常包含医疗保险、养老保险、失业保险、工伤保险和生育保险。
合作医疗仅包含医疗保险。
需要注意的是，这些信息可能会因地区和政策的不同而有所变化。如果您需要更详细的信息，建议咨询当地的社会保障机构
